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Eppendorf 艾本德中国

入驻年限:17

  • 联系人:

    徐文婷

  • 所在地区:

    上海 徐汇区

  • 业务范围:

    实验室仪器 / 设备

  • 经营模式:

    生产厂商

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mRNA研发的基石!质粒高效分离方案

209 人阅读发布时间:2025-06-03 14:42

在分子生物学的前沿领域,质粒 DNA 作为基因克隆、蛋白质表达、疫苗研发及 mRNA 疗法开发的基石,其质量与纯度直接决定了下游实验的成败。以mRNA 疫苗研发为例,在实操过程中,mRNA 的制备首先要制备含靶基因的质粒,再用 IVT(In Vitro Transcription)技术在体外进行转录,合成具有治疗属性的 mRNAs。因此,提高体外转录的效率,优化质粒DNA的纯化工艺是绕不开的一环。

 

今天介绍的应用文献,通过组合使用 3 种不同通量的转子, 依次实现了细菌大体积收获(R9A2 转子)、质粒 DNA 纯化(R15A 转子)和 PCR 产物小体积高通量纯化(R22A4 转子)。通过使用同一台离心设备,在相对一致的实验条件下可以减少变量,极大程度避免获得质粒载体间的差异,为体外转录 mRNA 生产流程奠定了坚实的基础

 

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1. 细菌培养:

将细菌接种后在 37℃ 培养箱中培养 24 小时,挑取单克隆菌落,在摇床(Innova® S44i 摇床)中扩增并甘油冻存。在 250 mL 培养瓶中预培养,之后再扩增到 2.5 L 培养瓶中培养,并对细菌进行沉淀离心(CR22N 高速落地离心机 R9A2 转子 4℃,3,340 xg 离心 30 分钟),将细菌沉淀物重悬用于 DNA 纯化。

 

2. 质粒纯化:

用 25 mL 缓冲液 P1 重悬沉淀物,并将其分配到 5 x 50 TC 离心管中。加入缓冲液 P2(5 ml)孵育3分钟,然后加入缓冲液 P3(5 ml)。使用 R15A 转子,4°C,20,000 xg 离心 30 分钟。

 

将缓冲液 PE(700 uL)加入柱膜中进行洗涤,并使用 R22A4 转子在 4℃,20,000 xg 下将离心柱离心两次,每次 1 分钟。之后在 4℃,20,000 xg 下将离心柱离心两次(1 min),并用 200 μL 水洗脱 DNA。

 

3. 质粒线性化和纯化:

将含有质粒(500 ng/uL)、5 uL 缓冲液(100x)、0.5 μL BSA(10x)、Spel(0.1 U/uL)和水的 50 uL 单个限制酶切消化物在混匀仪(Eppendorf ThermoMixer® C)中,37℃,培养 2 小时。然后,在80℃,灭活 20 分钟。

 

将混合物转移到离心柱中, R22A4 转子进行离心(4℃,17,900 xg,1min)。用 0.75 mL PE 缓冲液洗涤 DNA,再次离心(4℃,17,900 x g,1 min)。最后,用 50 μL 水在 4℃,17,900 xg,洗脱 1 分钟。

 

4. 通过聚合酶链式反应(PCR)添加 poly-(A)尾

设计引物后通过在 PCR 进行扩增,可以使用 poly(A)聚合酶为 mRNA 添加 poly-(A)尾。并将样品储存在 -20℃ 下,用于进一步分析。

 

5. 体外转录:

使用纯化加尾 PCR 产物作为反应模板,将定制的核糖核苷混合物涡旋并短暂离心。将溶液在 PCR仪 (MasterCycler@ X50 Aluminum)中,37°C 下孵育 4 小时。培养后,向样品中加入 2 uL Turbo DNase,并在 37°C 下孵育 15 分钟,纯化 RNA。

 

6. 电泳

使用琼脂糖凝胶电泳或聚丙烯酰胺凝胶电泳来分离和检测 mRNA,评估 mRNA 的纯度和完整性。

从细菌培养到体外转录的过程中,每一步对分离样品的要求都在变化,离心机转子的通量和转速也随之发生改变。那么,如何为离心的各个阶段选择合适的转子呢?

 

作为样本处理专家,Eppendorf 始终致力于在不同阶段为用户实现优异的样本分离效果。在质粒纯化的多步流程中,使用 Eppendorf CR22N 高速落地离心机,搭配多种转子,一切离心难题都不在话下!

 

R9A2 转子-超大容量细菌沉淀

R9A2 转子最多可以容纳 4 个 1.5 L 离心瓶。单次运行可以容纳 6 L 培养基,与传统的 6 x 1 L 容量转子相比,处理时间可节省 32%,大幅提高收获效率。
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▲ R9A2 转子:大口径 1.5 L 三角离心瓶

 

R15A 转子-高效质粒DNA纯化

同时离心 10 x 15 mL 和 10 x 50 mL 锥底管,无需适配器;灵活应对不同样本量与实验需求。
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▲ R15A 转子

 

R22A4转子-满足酶切&PCR产物纯化

R22A4 转子最多可容纳 30 根微量离心管,可使用离心柱在 1.5/2 mL 离心管中完成纯化,同时可用于 PCR 产物纯化,提供高质量转录样本。

 

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▲ R22A4 转子

高速、稳定、容量大的离心机可以帮助我们更好的实现细菌样本的高通量收获,提升实验效率与结果质量。这款超大容量、多转子灵活应用的高速落地离心机一把搞定!

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